一九五九年，根据上级指示，学校进行了整顿，改名为松江农业学校。一九五九年四月桂启藩调离，松江县教育局长韩呜皋调任副校长，金睿华任教务长。经过整顿后的松江农校，连续三年扩大专业和招生名额，至一九六一年秋，松江农校占地面积达一百二十九亩（含农场土地六十九亩）。建筑面积约五千平方米，有实验农场、牧场、车间、实验室，还有图书馆及基本体育设施。开设了农学、牧医、农机、园林绿化、果树蔬菜五个专业，在校学生达六百一十六人，教职工七十七人。建立了校党、政、工、团及校务委员会等组织，学校已初具规模。
一九六二年，为贯彻落实中央“八字方针”，根据上级指示，撤销了园林绿化专业，果树蔬菜专业提前二个月毕业，部分学生、教职工按政策下放，秋季停止招生，当年市高教局主办的青浦农校撤销，该校畜牧班并入松江农校。
一九六三年秋，松江农校划归上海市农业局领导。松江农校与七宝农校实行统一联合招生，并贯彻“社来社去”办学方针，学校又有所发展。
一九六四年春，原上海农学院党委副书记孙诚朴调任松江农校校长。松江农校从一九五八年建立至一九六八年撤销止共有毕业生一千0四十二人。
文化大革命前十年的上海农业教育，道路坎坷曲折，但它所取得的成绩还是应当肯定的，它不仅为全市培养了三千余名农业科技人才，而且由于在办学过程中培养目标明确，并能根据农业和科技对人才的需求，不断调整专业结构，加强师资队伍建设和生产实习基地建设。以基地建设为例，学校除设有实习农场外还有果园、牧场、金工厂（车间）和家畜诊疗所等，为学生提供了良好的实践场所。在教学上更是强调理论联系实际，与生产劳动相结合，培养学生劳动观念和动手能力，使学生毕业后能很快适应生产第一线的需求。实践证明，这些毕业生的确得到了用人单位的认可和好评。他们成为这一历史时期上海农业和农业科技发展的一支重要力量，这其中还涌现了一大批农业科技和生产上的精英。如畜牧兽医专家姚龙涛，毕业后他长期从事畜牧兽医学的研究和科学技术普及应用工作，并取得了卓越成就，共获得各级科技成果三十一项，发表论文百余篇，其中四篇在国外专业书刊和国际专业会议上发表交流。他五次参加有关畜类疾病防治研究的国际大型会议，出国考察北美、欧洲、大洋洲、亚、非等三十多个国家。2001年光荣出席全国农业科技大会，被授予全国农业科技推广先进工作者称号，受到江泽民等国家领导人的接见。2004年他退休，但他退而不休，他先后受聘农业部动物及动物产品卫生质量监督检验测试中心客座研究员、中国科协全国病虫害防治专家组专家。他足迹遍及华夏各地，深受业内人士赞许。又如植物保护专家黄富英，她四十年如一日奋战在农业科技第一线，致力于研究农作物病虫害观测预报和防治工作，她的《稻飞虱迁飞规律在预测中的应用》获国家科委科技进步一等奖。除此，她多年来共获国家级科技进步奖三项，省、市级奖十二项，出版专著五部，为农业科技、为农业丰产丰收做出了重要贡献。再如园艺家、海派插花代表王路昌，他现任上海插花协会常务理事副秘书长，日本池坊圣流花道一级正教授，上海植物园绿化装饰艺术总监。他一生追求插花艺术，坚持献身园艺花艺事业，从而在花艺领域取得了显著成就，形成了中西合璧不拘一格的创作风格。2001年他获得第五届中国花卉博览会景点及插花一等奖。他多次出席国内花艺赛事，并任评委。现在他虽已退休多年，但仍从事着园艺花艺的设计规划和教学工作，继续传授他的技艺，发挥他的余热。还有上海市劳动模范、全国农林科普先进发明家、研究员顾德法，著名的动物摄影名师科普作家、高级工程师张词祖等等也在农业领域做出了令人称道的成绩，而这些名人也只能说是精英中的一小部分，更多的“上农人”是在农业科技和农业生产第一线上默默地辛勤耕耘。这些有志的“上农人”，对促进上海农业科技的普及和推广，推动生产力的发展起到了不可估量的作用。同时这十余年的办学，又为我们今天科学办学，管理办学，规模办学，培养合格人才，提供了丰富宝贵的经验。
